A Prefeitura de Ilhéus, em atendimento ao que preconizam os órgãos de saúde tanto de âmbito estadual quanto federal, segue a estratégia de saúde do plano de imunização contra a Covid-19 para atender igualmente as populações urbanas e da zona rural, com oferta da vacina para os grupos elencados como prioritários. De acordo com a secretaria municipal de Saúde, do total de 82.072 doses aplicadas, sendo 57.760 referentes à primeira dose e 24.312 da segunda dose, cerca de 3500 pessoas das áreas rurais do município foram imunizadas com as duas doses.

Já foram contempladas pessoas com comorbidades, como hipertensão e diabetes, em localidades como Castelo Novo, Banco do Pedro, Assentamentos João Amazonas e Fábio Henrique, Vila  Cachoeira, Salobrinho, Aritaguá, Vila Olímpio, São José, Sambaituba, Banco Central, Inema, Pimenteira, Novo Ilhéus, Maria Jape e Japu.